Undyn erwähnt kurz Alphys in der Szene sofort vor ihrem Kampf mit der Hauptfigur, sagend, dass "die Geschichtsbücher von Alphys [sie] haben denken lassen, dass Menschen" kühl waren (es wird später offenbart, dass die Geschichtsbücher wirklich manga sind). Wenn die Hauptfigur Undyn behilflich ist, wird sie häufig über Alphys in ihren Anrufen sprechen. An der Müllmüllkippe offenbart Undyn, dass sie sich zuerst dort getroffen haben. Als sie sich zuerst getroffen haben, hat Undyn Alphys bemerkt, "in den Abgrund starrend" und "nachdenklich" scheinend, so hat sie sie nach dem Abgrund gefragt, Alphys überraschend, der fortgesetzt hat, darüber zu sprechen, wo es, fesselndes Undyn und Anfang ihre Freundschaft geführt hat.

Alphys selbst trifft die Hauptfigur in ihrem Laboratorium. Sie erklärt, dass sie die Hauptfigur durch überall in der Untergrundbahn verborgene Kameras beobachtet hat, den großen Schirm im Laboratorium erklärend, das auf ihren Kopf eingestellt wird. Sie informiert sie über Mettaton, der scheint zu versuchen, die menschliche Hauptfigur zu töten. Mettaton platzt durch eine Wand und zwingt die Hauptfigur in eine Quizshow; Alphys gibt die Briefe der richtigen Antworten auf die Hauptfigur aus, aber Benachrichtigungen von Mettaton, wenn sie auf eine Frage über eines ihrer Lieblingsvideospiele selbst antwortet und das Quiz kurz nach dem Fragen beendet, in wen Alphys verknallt ist.

Alphys erklärt sich bereit, ihre Telefonnummer der Hauptfigur zu geben, aber sie bemerkt, dass ihr Mobiltelefon alt ist und es schnell befördert, es gebend, verbindet sich texting, eine Schlüsselkette, zu zwei "dimensionalen Kästen" und Zugang zum Internet der Untergrundbahn, sogar sie für das soziale Netz der Ungeheuer vertraglich verpflichtend. Nach dem Erklären der Steigungen eilt sie ins "Badezimmer" ihres Laboratoriums hin.

Während der Reise der Hauptfigur durch Hotland aktualisiert Alphys oft ihren Status online, schließlich sie nennend, um Hilfe und Informationen bezüglich der Rätsel im Bereich zu geben, aber manchmal ruft sie in der falschen Zeit. Sie hört auf, Statusaktualisierungen anzuschlagen, wenn sie begreift, dass die Hauptfigur sie auf ihrem Telefon erhält. Mettaton schikaniert die Hauptfigur in mehreren Mausefallen, aber jedes Mal informiert Alphys die Hauptfigur einer Telefonsteigung, die ihnen hilft. Wenn die Hauptfigur einigen der Herausforderungen von Mettaton fehlt, macht Alphys sich verantwortlich zu scheitern zu helfen, aber Mettaton lässt die Hauptfigur gehen, behauptend, dass Alphys die Hauptfigur oder sonst das Benennen einer Werbeunterbrechung gerettet hat.

Alphys führt die Hauptfigur durch den Kern, aber sie hat Schwierigkeiten, ihnen wegen des sich ändernden Lay-Outs des Kerns zu helfen. Wenn die Hauptfigur beschließt, ihren Richtungen nicht zu folgen, wird sie beunruhigt über ihr Vertrauen auf sie.

Wenn sie das Ende des Kerns erreichen, offenbart Mettaton, dass Alphys sich in die Reise der Hauptfigur eingefügt hat, um sich nützlich fühlen zu lassen: Sie hat Hotland und die verschiedenen Rätsel des Kerns und Fallen aktiviert, hat den Aufzug des Kerns unbrauchbar gemacht, und sie hat veranlasst, dass Mettaton die Hauptfigurenschwierigkeiten, alle gegeben hat, so dass sie später dazwischenliegen und den Eindruck geben konnte, dass sie half. Mettaton, Alphys verraten, schließt sich in mit der Hauptfigur, um sie zu töten und ihre Seele zu nehmen, um nach der Oberfläche abzureisen. Alphys sagt der Hauptfigur, den Schalter von Mettaton zu schnipsen, ihn verwundbar sowie bereit machend, die Leistung seines Lebens zu geben, der Hauptfigur erlaubend, den Kampf zu gewinnen.

Nach dem Kampf kommt Alphys zum Körper von Mettaton. Wenn die Hauptfigur Mettaton verschont hat, wird Alphys entlastet, um zu sehen, dass er überlebt hat und einfach an Batteriemacht knapp geworden ist. Wenn die Hauptfigur Mettaton getötet hat, wird Alphys immer nervöser, obwohl Versuche, sich zu beruhigen, sagend, dass sie immer einen neuen Roboter bauen kann

Alphys holt die Hauptfigur ein, bevor sie den Aufzug ins Neue Haus bringen, und zugibt, unehrlich der Hauptfigur gehandelt. Sie sagt ihnen, dass, um die Barriere durchzuführen, sie die SEELE von Asgore nehmen müssen, indem sie ihn töten. Sie reist dann ab.

In einem zweiten playthrough, oder wenn die Hauptfigur ihren lädt, sparen Sie Datei, und entspricht sie den Anforderungen für den Wahren Pazifistischen Weg, Undyn bittet die Hauptfigur, einen Brief an Alphys zu liefern.

Alphys sträubt sich dagegen, den Brief zu erhalten, weil sie viele böse Briefe erhalten hat. Sie verwechselt die Hauptfigur als der Schriftsteller des Briefs und geht an einem "Datum" mit ihnen, zur Müllmüllkippe gehend und auf Undyn stoßend. Sie sagt ihr über ihre "wissenschaftlichen" Tätigkeiten die Wahrheit, die wirklich ihre Hobbys sind. Papyrus nimmt Alphys für eine Lehre im Selbstbewusstsein weg, aber er beendet es früh und sendet ihr Haus.